随后，秋丰和秋韵的人联合到一起，纷纷上奏折，他们的意思是：“柴龚案”已经审结，有人再次翻案，就是栽赃陷害、图谋不轨。秋韵还派人去看望柴正和龚节，结果被御前侍卫哄走了。
天光皇帝一看就知道，秋丰和秋韵联手了。他勃然大怒，严厉斥责了秋丰、秋韵的人，还找理由治了几个人的罪。同时他下旨：刑部尚书方庄、户部尚书乐升、左都御史何一新和卫客会同办案，一查到底。
卫客派御前侍卫，立刻把天通钱庄的有关人员都抓了。方庄和乐升派人封存了天通钱庄总号的库房及京城的产业，同时给各地下公文，把天州各处的天通钱庄查封，以便审案。
方庄、乐升、何一新和卫客立刻提审柴正、龚节等人，根据奏折弹劾的内容一条一条地查，很快就查清了天通钱庄的多项罪名。他们联名上奏折，详细禀报了案件的情况。
天光皇帝立刻同意了他们结案的意见，下旨严惩。
全国天通钱庄及其产业尽数被查抄、充公，涉案的所有相关人员都被依法查办，杀的杀，关的关，抄家的抄家，流放的流放。
天通钱庄是天机国第一大钱庄，在全国各州、郡、县有大大小小的分号，相关产业众多。
乐升负责此案钱粮、产业的处置，他把没收的产业都变卖了，把所有珠宝、古玩、字画等送入皇宫，一大部分钱放入皇宫，一小部分用于梦州、甲州、新州、力州等州，其余补充国库，统一调度。
在乐升的建议下，天光皇帝免除了多个州的欠税。为了补偿乐升，他赐给乐升几处大庄园。
刑部尚书、内阁大学士方庄办案有功，被封为正忠伯左都御史何一新领内阁大学士衔兵部尚书于文清协助办案有功，领内阁大学士衔卫客封为奉国将军、总督，不再掌管御前侍卫，管辖新州、魔州、情州和欲州。其他相关立功的官员都有封赏。
右都御史杨亮是秋韵的人，本来这个案子和他没关系，因为他上奏折支持不能查办“柴龚案”，被罢官，罚回老家悔过。刑部侍郎田子风接替了他的位子。
吏部尚书钱自书也是秋韵的人，还好他聪明，力劝秋韵不得，他就只能上了一道模嶙两可的奏折，即支持查案，又觉得要慎重，这才没被牵连进去。眼见事态不妙，他没和秋韵商量，以病为由辞官。天光皇帝同意了，却没让他走，而是给他安排了一个闲职，留任京城。文书院的内阁大学士吴永定接替了他的位子。
礼部尚书谢静伟是秋丰的人，就因为支持不查案，他也被罢官，罚回了老家。文书院的内阁大学士张鹏接替了他的位子。
自此，六部尚书和左、右都御史中，除了兵部尚书于文清是仁元王秋山的人，左都御史何一新是义元王秋水的人，其他都是天光皇帝的亲信近臣。
魔兵之乱后，五大皇子中，只有秋丰是亲王，而且随时可能被贬为郡王。名声扫地，倍受打击。“天通案”后，更是雪上加霜，他已经沦落成为二流皇子。去平乱的路上，他收了不少人，现在这些人基本都走了，不要说他们，那些跟随他多年的人也走了不少。他可以收六千门客，现在却连三百人都不到。不仅是门客，就连他一手扶植起来的不少官员都投靠了秋山和秋水。
最惨的是秋韵，他遭受了致命的打击。天通钱庄是他的命根子，现在没了。本来有三位尚书和一位右都御史是他的人，他们都被罢了官。他的嫡系们立刻人心尽散，除了几个忠心的还在，其他的不是在观望，就是已经投靠了秋山和秋水。门客和幕僚大量出走，只有不到一百人，而且还有人在走。名誉扫地，人财尽失！这位以贤闻名于世的贤元王，挂着元王的头衔，却已经成为二流皇子。