“大家不需要讨论了。请史将军为副帅，马上集结部队，明天我们就出发。”帝尧毫不犹豫地发出了指令。
这时候，丹朱以丹的首领名义，把丹地的部队也召集过来了。他们在南方定居，非常适应水战，而丹朱本就习惯了水上的生活，就由他统率水军，三苗首领统帅陆军。
丹朱所统帅的水军，一个个都能在水面上行走，快步如飞。因此在战争的开始阶段，尧在水军在这方面，竟不是儿子的对手，接连吃了好几个败仗，免不了损兵折将。
“看来，我还是小看了丹朱。”帝尧分析了情况后，对手下的将领们说：“我本来以为三苗的部队历来英勇善战，所以我们一开始就针对丹朱的水军。现在看来我们的决策是错误的。三苗的部队由丹朱带领，并不想造反，不一定会和我们拼命，我们不如先从陆地着手，把陆军打败后，水军没有了接应自然不足为虑了。”
下令中央军集中兵力对付三苗的陆军。
三苗的军队没有其他的特殊技能，只是比较凶猛而已，而且他们的部队不可能有中央军那么多。很快他们就溃不成军了，再也不能和丹朱的水军配合作战。
这样一来，帝尧只需要面对丹朱的水军了，在当地附近的一些部落的帮助下，他们在岸上把丹朱的水军围了个水泄不通。
丹朱的水军在水里，少了陆军的配合，没有了给养，只能干着急。就这样，帝尧只用了十多天的时间，就把丹朱的水军打败了。
失败的丹朱，带着他剩余的部众落荒而逃，从三苗这个地方一直逃到了南海的边上。这时的丹朱就像一只落荒的狗一样，面对茫茫的大海，进不能进，退不能退。
面对前有大海，后有追捕的局面，丹朱仰天长啸：“真是天亡我也。没想到父亲的作战能力和智慧根本不是我能抵挡的。但是他却一直看不起我，我决不会向他低头。”
“公子，我们怎么办？”他的部下们一直忠心耿耿跟着自己的首领，眼看着主公失败，现在都六神无主了。
“只是苦了你们了。我不但没有让你们奔得个好的前途，却可能要害你们丢掉了性命。我还有什么脸面活在世间。”丹朱已经走投无路，却又不肯向父亲屈服，面对部众，泪光闪烁，把心一横，大吼一声，跳到大海里自杀了。
丹朱死后，他的灵魂变成了一只鸟，人们把这种鸟叫做“朱”，它的形状有些像猫头鹰，一对脚爪却好像是人的手。它出现在哪里，哪里的就会有人被放逐。所以人们都说朱鸟是一种不祥的鸟。
丹朱因为在丹水建树较多，很受这个地方的百姓的爱戴，他们认为丹朱与尧舜的治国本领不分上下。丹朱死后，部落的人们对其有怀念之情，在濮城东临朐镇西朱封村西北150米处，给他建了个衣冠冢，传说当时这个陵墓占地两亩多，其墓望之如山，名曰“丹朱墓”。但是现在垄土已平，轮廓不清，所占地盘也很小了。